Городской флаг Керчи утверждён решением 11-й внеочередной сессии горсовета от 19 октября 1999 года. "Об утверждении Герба и Флага города-героя Керчи" за подписью Городского головы О.В.Осадчего. Флаг Керчи состоит из семи горизонтальных полос, попеременно красных и белых. Ширина красных полос относится к ширине белых как 1:0,65. Длина полотнища

в полтора раза больше его ширины. 

Красный цвет повторяет цвет герба города, а также символизирует мужество защитников Керчи, пролитую за свободу кровь, верность Родине, Белый символизирует чистоту помыслов, честь и благородство. Четыре красных полосы вместе символизируют четыре периода в истории города: античность, средневековье, возрождение и современность; а также четыре нации, сделавшие вклад в развитие Керчи - греки, скифы, тюрки, славяне.

Автор-разработчик флага (и современного герба) Керчи - А.А.Сальников.

Вот, что пишет о причинах выбора дизайна флага сам автор:

"1. Сочетание красного (пурпурного) и белого цветов издавна, а тем более в античные времена служили основными цветами для царской одежды, в том числе и для царей Боспорского царства. Кроме того, паруса царских кораблей Пантикапея состояли из красных и белых полос. Лишним будет говорить, что такие одежда и парус выделяли человека и корабль на общем фоне.
2. На территории города находится древнейшая из сохранившихся на территории бывшего СССР православная церковь Храм Святого Иоанна Предтечи. Крестово-купольное здание церкви построено византийскими зодчими и датируется 757 годом (по надписям на колоннах), т.е. сооружено более чем за 200 лет до крещения Руси. Единственным декоративным украшением фасада церкви являются 4-рядные пояса плинфы - тонкого красноглиняного кирпича, служившие ещё и антисейсмическими поясами, гасившими ударную волну землетрясений. Благодаря этим поясам здание церкви за свою историю пережило не менее 3 разрушительных землетрясений силой более 9 баллов. Церковь ныне действующая, служба в ней прерывалась только в период с 1932 по 1988 год".

Композиция городского флага напоминает 4-рядные пояса церкви.

В тексте использованы сообщения главного архитектора Керчи А.А.Сальникова